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利用异源酶组合构建酿酒酵母中咖啡酸的生物合成 Article
刘岚清, 刘宏, 张伟, 姚明东, 李炳志, 刘夺, 元英进
《工程（英文）》 2019年 第5卷 第2期 页码 287-295 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.029
微生物中构建植物源天然产物的生物合成面临着许多挑战，尤其是当需要表达与激活植物源细胞色素P450酶的时候。通过从几种细菌中筛选HpaB和HpaC两种酶，本文在酿酒酵母中构建了具有活性的4-羟基苯乙酸3-羟化酶（4 HPA3H），它可以发挥植物源细胞色素P450酶的相似作用，用于生产咖啡酸。在与一个共同的酪氨酸氨裂解酶（TAL）协同作用下，不同的异源HpaB酶和HpaC酶组合在将底物L-酪氨酸转化为目标产物咖啡酸上展现出不同能力。以铜绿假单胞菌的HpaB酶和肠沙门氏菌的HpaC酶的异源酶组合可生产最高咖啡酸产量，摇瓶培养下可达到（289.4 ± 4.6）mg·L−1。酵母底盘细胞与异源酶的相容性得到了有效的改善，咖啡酸的产量比初始值提高了40倍。
糖尿病发作后心脏脂蛋白脂肪酶的变化 Review
Chae Syng Lee, Yajie Zhai, Brian Rodrigues
《工程（英文）》 2023年 第20卷 第1期 页码 19-25 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.013
通过蛋白质工程提高聚酯水解酶对PET 塑料的降解效率 Article
马渊, 姚明东, 李炳志, 丁明珠, 何博, 陈思, 周晓, 元英进
《工程（英文）》 2018年 第4卷 第6期 页码 888-893 doi: 10.1016/j.eng.2018.09.007
来自Ideonella sakaiensis 的聚对苯二甲酸乙二醇酯水解酶（PETase）在室温下具有很强的降解聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）的能力，因此被认为是解决聚酯塑料污染问题的潜在工具为了更加快速地筛选突变体酶的活性，本研究利用无细胞蛋白表达体系对设计的PETase 突变体进行高通量的表达和验证。最终发现三种突变体（R61A、L88F 和I179F）的酶活性相比野生型分别提高了1.4 倍、2.1 倍和2.5 倍。其中，I179F突变体的酶活性最高，降解效率为22.5 mg·μmol–1·d–1。因此，本研究通过蛋白质工程对PETase 的关键疏水位点进行设计和改造，获得了降解效果提高的酶突变体，并进一步证实了其生物降解塑料的潜力。
主动源在高频被动源面波测量中的应用 Article
程逢,夏江海,沈超,胡悦,徐宗博,宓彬彬
《工程（英文）》 2018年 第4卷 第5期 页码 685-693 doi: 10.1016/j.eng.2018.08.003
被动源面波可弥补主动源面波测量中低频信息缺失的不足，因此引起人们的广泛研究。然而，被动源面波法不能提供高达几十赫兹的相速度信息，因此需要通过主动源面波法拓展频率范围。为了减少野外工作量，本文设计了一种高频被动源面波的勘探策略，即在连续的被动源面波测量过程中引入人工震源。我们称其为“混合源面波”（mixed-source surface-wave，MSW）测量。研究人员分别在学校内、马路边、铁路旁这三个噪声等级不同的地点记录短时长（10 min 内）被动源面波和混合源面波。频谱分析表明，在连续的被动源面波观测中加入人工震源可以改善高频段能量。笔者认为，相较于进行单一的主动源面波测量或被动源面波测量，在地震勘探中进行混合源面波测量具有建设性意义。
无源互调测量——挑战与解决方案 Review
蔡张华, 刘列, Francesco de Paulis, 漆一宏
《工程（英文）》 2022年 第14卷 第7期 页码 181-191 doi: 10.1016/j.eng.2022.02.012
关键词： 无源互调 (PIM) PIM源定位 消声室
基于人工智能的肺癌NOG/PDX模型驱动基因匹配预测 Article
何雅億, 郭皓越, 刁丽, 陈宇, 朱俊杰, Hiran C. Fernando, Diego Gonzalez Rivas, 祁辉, Chunlei Dai, 汤旭蓁, 朱军, 戴家威, 何侃, Dan Chan, 杨洋
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 102-114 doi: 10.1016/j.eng.2021.06.017
患者源性肿瘤异种移植物（PDX）是癌症药物发现和筛查的有力工具。
关键词： 机器学习 患者源性肿瘤异种移植物 NOG小鼠
邓新蒲
《中国工程科学》 2007年 第9卷 第11期 页码 54-62
可观测性分析是单观测器无源定位首先要研究的问题，只有当目标状态 (位置、速度等)是完全可观测的，定位和跟踪问题才能有可靠的、唯一的解。从几何方法、代数方程方法、线性系统方法3方面来阐述单站测角无源定位的状态可观性问题，讨论测频单站无源定位问题的可观测性和定量的可观测性，并对近年来这一领域的相关文献的分析方法和结论进行评述。
朱红,祝龙记,夏若飞
《中国工程科学》 2014年 第16卷 第3期 页码 86-91
城市大气污染源追踪“广义判识”与Nudging源同化集成技术途径
徐祥德,丁国安
《中国工程科学》 2012年 第14卷 第10期 页码 10-22
提出了城市大气污染源追踪“广义判识”综合应用平台、模式源同化及其卫星遥感应用等新技术。“广义判识”综合应用平台包括气溶胶源主因子分析方法、气溶胶周期变化谱分析法、城市冠层大气污染变化规律同位相特性分析、追溯远距离空气污染源的合成风场相关矢量法、后向轨迹示踪法和边界层影响足痕分析法；另外，为解决长期以来大气污染模式中排放源不确定性的关键技术难点，采用源同化牛顿逼近Nudging技术，获取具有季节、月变化动态变化特征的SO2、NO2区域反演源排放清单。将卫星遥感资料应用在同化模型，探索空气污染预报模式的卫星遥感产品应用技术，卫星遥感—地基观测综合分析平台亦可广泛地应用于城市污染源追踪、城市雾和城市热岛的研究，并提出多圈层水—土—气综合分析方法是一种追踪水污染源的探索性尝试
重构异戊二烯焦磷酸代谢以促进萜类化合物的合成 Article
徐显皓, 吕雪芹, 崔世修, 刘延峰, 夏洪志, 李江华, 堵国成, 李兆丰, Rodrigo Ledesma-Amaro, 陈坚, 刘龙
《工程（英文）》 2023年 第28卷 第9期 页码 166-178 doi: 10.1016/j.eng.2023.03.019
碳青霉烯类耐药性在人源和动物源产NDM酶大肠埃希菌间的传播 Article
沈应博, 胡付品, 王永强, 尹丹丹, 杨璐, 陈义强, 许春燕, 李基云, 蒋君瑶, 王雪杨, 付玉林, 邵东延, 刘德俊, 马藤菲, 蔡畅, 沈张奇, 王少林, 李娟, 张嵘, 柯跃斌, 吴聪明, 沈建忠, Timothy R. Walsh, 汪洋
《工程（英文）》 2022年 第15卷 第8期 页码 24-33 doi: 10.1016/j.eng.2021.07.030
Although carbapenem use is prohibited in animals in China, carbapenem-resistant Escherichia coli (CREC), especially New Delhi metallo-β-lactamase (NDM)-producing strains, are widely prevalent in foodproducing animals. At present, the impact of livestock-associated CREC strains on human populations at the national level is unknown. Here, we conduct a retrospective cross-sectional study to investigate the prevalence of CREC from clinical settings across 22 Chinese provinces or municipalities and analyze anthropogenic factors associated with their presence. We also ascertain the blaNDM and blaKPC abundance among pig and chicken farms and present a detailed genomic framework for CREC of animal and human origin. Overall, 631/29799 (2.1%) clinical Escherichia coli (E. coli) isolates were identified as CREC. Multivariable analysis revealed that being male, an age below 1, an age between 13 and 18, provinces with greater chicken production, and provinces with higher pig production were associated with higher odds of CREC infection. In general, 73.8% (n = 45/61) of pig farms and 62.2% (n = 28/45) of chicken farms had a blaNDM abundance of 1×10－5 to 1×10－3 and 1×10－3 to 1×10－2, respectively. Among all the Chinese NDM-positive E. coli (n = 463) available at the National Center for Biotechnology Information (NCBI), the genomic analysis revealed that blaNDM-5 and IncX3 were the predominant carbapenemase gene-plasmid combination, while a highly homogeneous relationship between NDM-positive isolates from humans and animals was demonstrated at the plasmid and core genome levels. All the findings suggest frequent CREC transmission between humans and animals, indicating that further discussions on the use of antibiotics in animals and humans are needed, both in China and across the globe.
关键词： Carbapenem resistance Escherichia coli blaNDM-5 One Health Antimicrobial resistance transmission
吴晓梦
《中国工程科学》 2014年 第16卷 第11期 页码 82-85
标题 作者 时间 类型 操作
基于人工智能的肺癌NOG/PDX模型驱动基因匹配预测
何雅億, 郭皓越, 刁丽, 陈宇, 朱俊杰, Hiran C. Fernando, Diego Gonzalez Rivas, 祁辉, Chunlei Dai, 汤旭蓁, 朱军, 戴家威, 何侃, Dan Chan, 杨洋
期刊论文
碳青霉烯类耐药性在人源和动物源产NDM酶大肠埃希菌间的传播
沈应博, 胡付品, 王永强, 尹丹丹, 杨璐, 陈义强, 许春燕, 李基云, 蒋君瑶, 王雪杨, 付玉林, 邵东延, 刘德俊, 马藤菲, 蔡畅, 沈张奇, 王少林, 李娟, 张嵘, 柯跃斌, 吴聪明, 沈建忠, Timothy R. Walsh, 汪洋
期刊论文
京公网安备 11010502051620号
